Как утверждает следствие, с 2013 года, в течении трех лет, Кубасай Кубасаев получал взятки от директора одного из республиканских предприятий. Взамен экс-глава УФАС Дагестана оказывал ему покровительство.
12 февраля, на начавшихся слушаниях в Лефортовском суде Москвы, Кубасай Кубасаев отверг все обвинения и не признал вину в получении незаконного вознаграждения в размере 2,5 млн.руб.
В 2018 году по ходатайству Генеральной прокуратуры Верховный суд изменил территориальную подсудность дела в отношении Кубасаева с Кировского районного суда Махачкалы на Лефортовский районный суд Москвы. Объяснялся перенос имеющимися у обвиняемого связями с сотрудниками правоохранительных и судебных органов, а также должностными лицами региональных министерств и ведомств.